前作の舞台となる島は噴火により滅亡。 資産家イーライの思惑により恐竜達は捕獲。 イーライはウー博士と組み、恐竜を様々なことに利用しようと企むが、 オーウェンやクレア、一緒に捕獲されたブルーによりこれを阻止。イーライ及び関係者は恐竜の暴走により…